إنطلاقاً من رسالة الكلية ودورها في الاهتمام بالبحث العلمي ورعاية المراكز البحثية، تحتضن الكلية اربع مراكز بحثية وهي:

مركز بحوث كلية علوم الأغذية والزراعة، محطة الأبحاث والتجارب الزراعية، مركز الإرشاد الزراعي، مركز التميز البحثي  في التقنية الحيوية. حيث تساهم الكلية في رعاية هذه المراكز ومساعدتها للقيام بدورها من خلال توفير ماتحتاج اليه من معامل ومكاتب ودعم فني وإداري. كما ترعى الكلية وبشكل مباشر كل من مركز الارشاد الزراعي، ومحطة الابحاث الزراعية وتوجه لنشاطاتها ميزانية سنوية تدعم نشاطها وتضمن استمرارية عطائها.