قبل أن نلخص أهداف الكلية، لابد من استعراض أهداف التعليم العالي، الذي تعد كلية العلوم إحدى ثمراته. وتلخص وثيقة سياسة التعليم في المملكة العربية السعودية (المعتمدة بقرار مجلس الوزراء رقم 799 في 17 /9/1389هـ) أهداف التعليم العالي فيما يلي:-

1. تنمية عقيدة الولاء لله ومتابعة السير في تزويد الطالب بالثقافة الإسلامية التي تشعره بمسئوليته أمام الله عن أمة الإسلام، لتكون إمكاناته العلمية والعملية نافعة ومثمرة.
2. إعداد مواطنين أكفاء مؤهلين علمياً وفكرياً تأهيلاً عالياً لأداء واجبهم في خدمة بلادهم، والنهوض بأمتهم في ضوء العقيدة السليمة ومبادئ الإسلام السديدة.
3. إتاحة الفرصة أمام النابغين للدراسات العليا في التخصصات العلمية المختلفة.
4. القيام بدور إيجابي في ميدان البحث العلمي الذي يسهم في مجال التقدم العالمي، في الآداب والعلوم والمخترعات، وإيجاد الحلول السليمة الملائمة لمتطلبات الحياة المتطورة واتجاهاتها التقنية (التكنولوجية).
5. النهوض بحركة التأليف والإنتاج العلمي بما يطوع العلوم لخدمة الفكرة الإسلامية، ويمكن البلاد من دورها القيادي لبناء الحضارة الإنسانية على مبادئها الأصلية التي تقود البشرية إلى البر والرشاد، وتجنبها الانحرافات المادية والإلحادية.
6. ترجمة العلوم وفنون المعرفة النافعة إلى لغة القرآن، وتنمية ثروة اللغة العربية من المصطلحات بما يسد حاجة التعريب، ويجعل المعرفة في متناول أكبر عدد من المواطنين.
7. القيام بالخدمات التدريبية والدراسات التجديدية التي تنقل إلى الخريجين الذين هم في مجال العمل ما ينبغي أن يطلعوا عليه مما جد بعد تخرجهم .
8. وبناءً على ما جاء في الأهداف العامة للتعليم فقد أقر مجلس كلية العلوم في جلسته الرابعة عشرة المنعقدة في 4/4/1406هـ (16/12/1985م) أهداف الكلية كما يلي:
9. المساهمة في إعداد الإنسان المؤمن بربه وبدينه الحنيف والملتزم بوطنه وبواجباته.
10. إعداد المتخصصين بالمستويات المختلفة والمهيأة في مجالات العلوم وتطبيقاته للإضطلاع بالمهام التالية:
11. المساهمة في استثمار الثروات الوطنية وفي بناء القاعدة الإقتصادية المتطورة للمجتمع السعودي وفي تسيير وإدارة المؤسسات المعنية بذلك.
12. شغل الوظائف التخصصية المناسبة في الوزارات والمؤسسات التابعة للدولة وفي المؤسسات والشركات العاملة في مجالات الصناعة أو الزراعة أو التجارة أو الخدمات أو غير ذلك.
13. العمل في مراكز البحوث في المملكة.
14. تدريس العلوم في مؤسسات التعليم العام أو المعاهد التربوية أو الفنية أو المتوسطة.
15. تقديم خدمات تعليمية للكليات الأخرى في الجامعة في ميادين العلوم.
16.  المساهمة في تلبية حاجات الجامعات والمعاهد العليا إلى أعضاء هيئة التدريس من خلال برنامج للدراسات العليا (درجة الماجستير والدكتوراه) يهدف إلى إعداد كوادر وطنية قادرة على قيادة النشاط العلمي في مجالات العلوم والإشراف عليه.
17.المساهمة في ملء الثغرة الكبيرة في المكتبة العربية عن طريق تشجيع التأليف بالعربية وترجمة أفضل الكتب المدرسية والمراجع العلمية إلى اللغة العربية.
18.المساهمة في تقديم العلوم على الصعيدين العربي والعالمي من خلال البحوث العلمية المبتكرة والمشاركة في المؤتمرات العلمية الدولية وإستضافة بعضها وعقد ندوات وطنية في مجالات العلوم. 19.القيام بالأبحاث العلمية التي تهدف إلى حل مشاكل التنمية والبناء في المملكة وتشجيعها، وذلك بغية الإسهام الجدي في دفع عجلة التطور ورفع وتائره باستمرار.
20.تقديم الخبرة والمشورة التخصصية لكافة الجهات الحكومية والمؤسسات والشركات التي تطلب ذلك.
21.تنظيم وتنفيذ دورات تدريبية متخصصة.
22.المساهمة في تعريف الجمهور وتوعيته بأهمية العلوم والدور الذي تلعبه في حياة البشر وتقدمهم الحضاري.