تساهم الأقسام العلمية في تدريس مقررات الخطة الدراسية للكلية كما تمنح الأقسام درجة الماجستير التخصصية التالية:
قسم علم الأدوية
يمنح درجة الماجستير في علم الأدوية
درجة الماجستير في علم السموم
قسم الصيدلانيات
يمنح درجة الماجستير في الصيدلانيات
يمنح درجة الماجستير في الرقابة النوعية للمستحضرات الصيدلية (بالاشتراك مع قسم الكيمياء الصيدلية)
قسم الصيدلة الإكلينيكية
يمنح درجة الماجستير في الصيدلة الإكلينيكية.
قسم العقاقير
يمنح درجة الماجستير في العقاقير
يمنح درجة الدكتوراه في العقاقير
قسم الكيمياء الصيدلية
يمنح درجة الماجستير في الكيمياء الصيدلية
يمنح درجة الدكتوراه في الكيمياء الدوائية ودرجة الدكتوراه في الكيمياء الصيدلية التحليلية