يوجد العديد من المصليات في مركز أقسام العلوم والدراسات الطبية موزعه حسب التالي :
1. مصلى مبنى رقم (3) المركز الترفيهي يتسع لـ (50 ) مصلي.
2. مصلى مبنى رقم (20) الدور الأرضي يتسع لـ (50) مصلي و صالة في الدور الأول تستخدم كمصلى.
3. مصلى مبنى رقم (6) الدور الأرضي يتسع لـ (150) مصلي.
4. مصليين في كلية الطب البشري للبنات وكلية الصيدلة في الدور الأرضي مبنى رقم (2) يتسع كل منهما لـ (50) مصلي.
تقام الأنشطة التالية :
· محاضرات، تحفيظ قرآن، أحاديث، حسب خطة نشاط المصلى.
· وتشرف على أنشطة المصلى بمركز أقسام العلوم والدراسات الطبية مديرة أنشطة الطالبات بالمركز.